COVID на жительство: в каких странах циркулирует «русский» штамм
«Русский» штамм полностью вытеснен в РФ вариантом коронавируса «Дельта», однако его можно встретить в США, Бельгии, Франции, Германии и Великобритании. Как рассказали «Известиям» в ЦНИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, эта линия интересна тем, что ее доля среди всех геновариантов вируса достаточно быстро росла сразу после появления, что, вероятно, говорит о его повышенной заразности. А наличие в геноме мутации E484K говорит о возможности ухода от иммунного ответа. Однако уже в июне этого года доля B.1.1.523 резко упала, уступая индийской линии. Специалисты считают, что «русский» штамм был едва ли не последним вариантом, который хоть как-то конкурировал с «Дельтой», и сейчас следует продолжать наблюдение за ним.
Штамм с московской пропиской
Сейчас в РФ уже не осталось «русского» штамма коронавируса, рассказали «Известиям» в ЦНИИ эпидемиологии Роспотребнадзора. Там уточнили, что геномы этого варианта SARS-CoV-2 с датой забора образца в конце августа еще можно найти в базе GISAID (база данных, куда специалисты из разных стран выкладывают геномные последовательности патогена). «Русский» штамм еще встречается в США, Германии, Великобритании, Франции, Бельгии, рассказал руководитель научной группы разработки новых методов диагностики заболеваний человека ЦНИИ эпидемиологии Роспотребнадзора Камиль Хафизов.
Ранее ученые из медицинского центра Маастрихтского университета Нидерландов опубликовали препринт, в котором подробно описали вариант B.1.1.523, отличающийся множеством спайковых мутаций. По мнению исследователей, он может быть опасен, поскольку быстро уходит от иммунного ответа. «Происхождение этого варианта, вероятно, русское, поскольку первый штамм — из Москвы», — указано статье.
— Значительная часть первых загруженных в международную базу данных GISAID геномов B.1.1.523 действительно большей частью происходят из России, — рассказал «Известям» Камиль Хафизов. — Уже чуть позже этот штамм начали находить и в других странах, в частности, в Германии, Латвии и даже Австралии. Специалисты нашего института, которые существенную долю образцов для секвенирования получали в то время именно из Москвы, начали обнаруживать этот штамм еще где-то в феврале 2021 года.
Мутации и делеции
«Русская» линия интересна тем, что ее доля среди всех геновариантов короновируса достаточно быстро росла сразу после появления, что, вероятно, говорит о его повышенной заразности, рассказали специалисты Роспторебнадзора. Уже в апреле-мае доля B.1.1.523 в Москве составляла порядка 50%, и это при том, что параллельно активно распространялись и другие значимые штаммы — «Альфа» и «Бета».
— У штамма B.1.1.523 есть мутация E484K, которая присутствует и в «Бете», и в «Гамме», и в ряде других геновариантов, — рассказал Камиль Хафизов. — И это геномное изменение как раз было частично ответственно за несколько сниженную эффективность нейтрализующих антител. Присутствует также делеция (вырезка) трех аминокислот в S-белке, а у «Дельты» в том же месте не хватает двух. Помимо этих двух перечисленных геномных изменений есть множество других, присущих в том числе иным геновариантам.
Наличие в геноме мутации E484K действительно говорило о том, что у этого варианта могли быть возможности для ускользания от иммунного ответа. Однако уже в июне доля B.1.1.523 резко упала, и интерес к нему был достаточно быстро потерян. В конечном итоге наибольшее распространение получила «Дельта».
— Еще в августе мы периодически наблюдали отдельные редкие образцы этого штамма, но уже в сентябре даже и не припомню, чтобы он обнаруживался среди партий отсеквенированных образцов, — отметил Камиль Хафизов.
Сбитый летчик
На данный момент «Дельта» остается доминирующим штаммом в России, сказал «Известиям» директор научно-клинического центра прецизионной и регенеративной медицины Института фундаментальной медицины и биологии Казанского федерального университета Альберт Ризванов. А предугадать инфекционные параметры будущих лидеров этой гонки крайне сложно, добавил он.
— Конечным мерилом опасности того или иного штамма нужно считать распространение вируса в популяции, — отметил эксперт в разговоре с «Известиями».
В сравнении с исходным вариантом SARS-CoV-2 «русский» вариант коронавируса содержит ряд аминокислотных замен, рассказал «Известиям» профессор, член-корреспондент РАН, заведующий лабораторией биотехнологии и вирусологии Факультета естественных наук Новосибирского государственного университета Сергей Нетесов. Но большинство этих замен уже встречалось ранее у других вариантов.
— Поскольку он до сих пор не получил широкого распространения в сравнении с вариантами «Альфа» — «Дельта», то эксперты ВОЗ до сих пор его относят к низшей по значимости группе вариантов, — отметил эксперт. — В препринте статьи авторы из Нидерландов предполагают, что стоит рассмотреть его перемещение в следующую, более высокую по степени опасности вариантов группу, но на этом не настаивают. Хотя наблюдать специфически за этим вариантом стоит.
«Русский» штамм потенциально интересен и мог бы быстро заполонить собой как Россию, так и другие государства, если бы не «индийский брат», говорят эксперты. Как рассказали в ЦНИИ эпидемиологии, фактически B.1.1.523 был едва ли не последним вариантом, который хоть как-то конкурировал с «Дельтой», но полностью «проиграл» и сейчас относится скорее к исчезающим штаммам.
Ранее руководитель группы геномики и постгеномных технологий ЦНИИ эпидемиологии Роспотребнадзора Анна Сперанская рассказала «Известиям», что на начало сентября 2021 года на территории страны доминировала «Дельта» и несколько ответвившихся от нее линий — в основном AY.12 и AY.4.
